紧凑型蠕动泵低速时可以正常运转,但若高于一定速度就无法启动,并伴有啸叫声。空载启动频率，即步进电机在空载情况下能够正常启动的脉冲频率，如果脉冲频率高于该值，电机不能正常启动，可能发生丢步或堵转。在有负载的情况下，启动频率应更低。如果要使电机达到高速转动，脉冲频率应该有加速过程，即启动频率较低，然后按一定加速度升到所希望的高频（电机转速从低速升到高速）。
紧凑型蠕动泵在使用中要注意清理泵壳和泵管的杂物。因为蠕动泵是比较精密的仪器，所以主要依靠泵壳保持高精度的间隔，从而实现高效的挤压泵，泵管损伤导致液体流入泵壳压力轮和压力块及泵管时，泵头的挤压间隔可能会发生变化。微小的变化也会导致泵管过度的早期磨损，对泵产生严重的影响。可能会造成泵头损伤。
紧凑型蠕动泵管道材料的选择：
选择蠕动泵时要注意需要运输的液体是否会腐蚀泵管。由于泵管的材料很多，输送的液体种类也很多，所以没有能够承受所有液体的泵管，所以要确认自己的液体种类，通过化学常用表进行比较或浸泡实验，使泵管可用。
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